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30000+,百万月下载量:蓬勃生长的预印本

Nature自然科研 Nature Portfolio 2022-06-21

原文作者:Joshua Rapp Learn

现在每月从bioRxiv上下载的研究超过100万项,涉及的主要领域是神经科学、生物信息学和基因组学。

预印本服务器bioRxiv成立5年来,共有37,648篇研究成果发布在上面分析发现,2018年科研人员在bioRxiv上发布的预印本数量超过了前四年的总和


分析还显示,该网站的每月下载量已达到100万次。bioRxiv旨在发布生命科学领域的研究预印本,到去年11月已经满5年了。


负责此次分析的研究人员建立了一个包含所有bioRxiv预印本的交互式数据库,并将其公开发布在一个名为Rxivist的新网站上。本次分析结果也在1月13日发布在bioRxiv上。

预印本数量不断增长

分析发现,研究人员在2018年前11个月平均每月在bioRxiv发布1,711篇预印本。


明尼苏达大学的生物信息学研究人员Richard Abdill和Ran Blekhman表示,分析还发现,仅去年10月一个月的下载量就达到110万次,打破了此前的记录。首次发布预印本的研究人员数量从2014年的3,873人增加到2018年的84,339人。同期,在bioRxiv上发布预印本的研究人员总数从4,012人增加到了106,231人(参见“预印本发表情况概览”)


来源:R. J. Abdill & R. Blekhman bioRxi,预印本发表情况,https://doi.org/10.1101/515643 (2019)


发布和下载最多的预印本属于神经科学和生物信息学领域。另外,演化生物学、遗传学、基因组学和微生物学也跻身前十之列。


2016年或之前发布在bioRxiv上的预印本,有三分之二后来发表在同行评议期刊上,大多数发表时间是在预印本发布后的六个月内。


在bioRxiv上下载次数较多的预印本,相比那些下载量相对少的预印本,其最终发表的期刊的影响因子一般更高一些(参见“预印本的最终结局”)

来源:R. J. Abdill & R. Blekhman Preprint at bioRxiv https://doi.org/10.1101/515643 (2019).

有42%的预印本最终在专业期刊上发表。已发表预印本数量最高的三本期刊分别是《科学报告》、eLifePLoS ONE ,每本的发表数量都超过了700篇(参见“影响因子”)

来源:R. J. Abdill & R. Blekhman Preprint at bioRxiv https://doi.org/10.1101/515643 (2019).

未来走向

研究指出,预印本让读者能够早先一步了解最新研究成果。


预印本使我能在研究进行时就看到研究的趋势,并且还能看到关于所涉研究的评论。”《神经科学研究期刊》的总编Eric Prager说,“我认为这可以让同行了解正在进行的研究以及有可能取得的进展,也可以对尚未投稿的论文提出有益意见。”


Rxivist还通过下载次数或Twitter提及次数对bioRxiv预印本进行分类和筛选,帮助人们更好地了解生物学研究的趋势。


Abdill说:“将Twitter提及次数与关于论文内容的经验判断挂钩显得投机。”但是,这是找到最受关注的论文的有效方式,即便这种关注是负面性的,他补充道。


耶鲁大学神经科学家、《神经科学杂志》总编Marina Picciotto说,预印本网站还能帮助研究人员交流那些可能无法被同行评议期刊发表的内容(《神经科学杂志》是发表预印本数量居前二十的期刊之一。)Picciotto表示,她所说的包括不那么吸引人的基准数据,比如阴性结果,这些内容很少发表在期刊上。“预印本服务器可以与传统期刊发挥互补作用。”她说。


原文以What bioRxiv’s first 30,000 preprints reveal about biologists为标题

发布在2018年1月22日的《自然》新闻上


Nature|doi:10.1038/d41586-019-00199-6

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